MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Cryptocercus punctulatus) str. Cpu plasmid pCpu

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016598	T	6	6	21	26	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016598	ATGG	2	8	119	126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016598	GATAA	2	10	132	141	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016598	TGCTTT	7	42	190	231	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016598	TTC	2	6	247	252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016598	AAT	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016598	T	8	8	258	265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016598	TTC	2	6	289	294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016598	TTC	2	6	319	324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016598	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016598	AGG	2	6	367	372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016598	T	6	6	399	404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016598	TCT	3	9	410	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016598	ATC	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016598	ATG	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016598	A	6	6	460	465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016598	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016598	GATAA	2	10	473	482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016598	A	9	9	481	489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016598	T	6	6	493	498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016598	T	8	8	512	519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016598	T	9	9	530	538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016598	ATT	2	6	544	549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016598	CATA	2	8	550	557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016598	CAT	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290639
26	NC_016598	AGC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374290639
27	NC_016598	ATT	3	9	689	697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290639
28	NC_016598	GAAA	2	8	707	714	75 %	0 %	25 %	0 %	374290639
29	NC_016598	GAG	2	6	846	851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374290639
30	NC_016598	ATA	2	6	923	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290639
31	NC_016598	A	6	6	964	969	100 %	0 %	0 %	0 %	374290639
32	NC_016598	AAAT	2	8	971	978	75 %	25 %	0 %	0 %	374290639
33	NC_016598	AT	3	6	1026	1031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016598	TA	3	6	1033	1038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016598	T	6	6	1110	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016598	AGA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016598	CTT	2	6	1161	1166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016598	T	10	10	1178	1187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016598	T	6	6	1205	1210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016598	AT	3	6	1211	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016598	TAT	3	9	1231	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016598	AAAG	2	8	1250	1257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016598	T	8	8	1269	1276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016598	ATT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016598	AAT	2	6	1304	1309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016598	ATT	2	6	1326	1331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016598	T	8	8	1384	1391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016598	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016598	CATT	2	8	1408	1415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016598	CAT	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016598	T	8	8	1472	1479	0 %	100 %	0 %	0 %	374290640
52	NC_016598	TA	3	6	1491	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
53	NC_016598	AACA	2	8	1520	1527	75 %	0 %	0 %	25 %	374290640
54	NC_016598	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
55	NC_016598	TAT	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290640
56	NC_016598	ATTT	2	8	1586	1593	25 %	75 %	0 %	0 %	374290640
57	NC_016598	T	7	7	1632	1638	0 %	100 %	0 %	0 %	374290640
58	NC_016598	AT	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
59	NC_016598	TCA	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290640
60	NC_016598	TTC	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290640
61	NC_016598	A	6	6	1742	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	374290640
62	NC_016598	AAT	2	6	1769	1774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290640
63	NC_016598	GTT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290640
64	NC_016598	TA	3	6	1847	1852	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
65	NC_016598	ATC	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
66	NC_016598	TCTT	2	8	1917	1924	0 %	75 %	0 %	25 %	374290641
67	NC_016598	T	9	9	1948	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
68	NC_016598	T	6	6	1966	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
69	NC_016598	ATC	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
70	NC_016598	CAAAA	2	10	1979	1988	80 %	0 %	0 %	20 %	374290641
71	NC_016598	A	7	7	2042	2048	100 %	0 %	0 %	0 %	374290641
72	NC_016598	TA	3	6	2075	2080	50 %	50 %	0 %	0 %	374290641
73	NC_016598	TTTAA	2	10	2145	2154	40 %	60 %	0 %	0 %	374290641
74	NC_016598	TTC	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
75	NC_016598	TC	3	6	2190	2195	0 %	50 %	0 %	50 %	374290641
76	NC_016598	AATAAA	2	12	2234	2245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290641
77	NC_016598	T	6	6	2250	2255	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
78	NC_016598	TCCAT	2	10	2265	2274	20 %	40 %	0 %	40 %	374290641
79	NC_016598	AATA	2	8	2275	2282	75 %	25 %	0 %	0 %	374290641
80	NC_016598	T	6	6	2298	2303	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
81	NC_016598	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
82	NC_016598	TTC	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
83	NC_016598	A	6	6	2380	2385	100 %	0 %	0 %	0 %	374290641
84	NC_016598	TTG	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290641
85	NC_016598	AAT	2	6	2433	2438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290641
86	NC_016598	AGA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374290641
87	NC_016598	CTG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374290641
88	NC_016598	CAG	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374290641
89	NC_016598	TAT	2	6	2515	2520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290641
90	NC_016598	TCT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
91	NC_016598	A	6	6	2589	2594	100 %	0 %	0 %	0 %	374290641
92	NC_016598	AATAAG	2	12	2629	2640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290641
93	NC_016598	CAT	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
94	NC_016598	AAT	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290641
95	NC_016598	AT	3	6	2773	2778	50 %	50 %	0 %	0 %	374290641
96	NC_016598	TTG	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290641
97	NC_016598	TTCT	2	8	2956	2963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016598	TAA	2	6	2986	2991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016598	A	6	6	2990	2995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016598	A	8	8	3014	3021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016598	AT	3	6	3045	3050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016598	ATA	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016598	T	8	8	3073	3080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016598	CG	4	8	3128	3135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016598	ATATT	3	15	3194	3208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016598	TA	3	6	3212	3217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016598	ATT	2	6	3221	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016598	TA	5	10	3227	3236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016598	T	9	9	3241	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016598	A	8	8	3250	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016598	ACAA	2	8	3260	3267	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016598	T	8	8	3286	3293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016598	A	7	7	3300	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016598	ACTA	2	8	3317	3324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016598	GC	4	8	3342	3349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016598	ATATT	3	15	3409	3423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016598	TA	3	6	3427	3432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016598	ATT	2	6	3436	3441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016598	TA	5	10	3442	3451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016598	T	9	9	3456	3464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016598	A	8	8	3465	3472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016598	ACAA	2	8	3475	3482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016598	T	8	8	3501	3508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016598	A	7	7	3515	3521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016598	ACTA	2	8	3532	3539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016598	GC	4	8	3557	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016598	CGATC	2	10	3586	3595	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016598	ATGG	2	8	3700	3707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016598	TACCC	2	10	3778	3787	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_016598	C	6	6	3799	3804	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_016598	A	6	6	3805	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.